首先，制度不健全导致管理体制落后。美国高校实验室实行的是独立自治的管理体制，实验室作为一个独立实体，互不干涉，这样避免了因权责不明或跨级越权而产生的麻烦;日本高校实验室实行的是二级三层次管理体制，学部和学校管理不同层次的实验室，为不同需求的用户服务，这样有效地提高了使用率;而我国实行的是上下级直属关系的管理模式，这样导致权力责任过于集中，容易产生隶属矛盾的问题。
　　
　　第二，产权关系导致实验室建设重复浪费。我国高校实验室实行“学校—学院—实验室”的三级管理体制，产权归学校，管理归学院，使用权归实验室，专属特征明显。由于建设经费的多头管理和封闭使用，导致出现仪器设备重复购置、使用效益低下等问题。
　　
　　第三，队伍不完善导致实验室服务质量低下。国外实验室通常建设有一支各司其职、各尽其能的队伍，技术人员具备熟练的专业技能，管理人员具有扎实的专业基础。我国高校实验室角色分配松散，较少配备专职人员，往往由任课教师承担实验教学和管理，学术重担导致其不能全身心投入，而雇员制实验员专业基础相对薄弱，更像是仪器设备的保管专员，而不是具有专业背景的管理专员。
　　
　　为了破解实验室困局，可从以下六个方面改革：
　　
　　首先，实施固定资产有偿使用制度，科学调控资源配置。根据“量有为用，量需调控”的原则，优先考虑教学和科研发展需求，保障基础，对重点支持和发展的平台、项目及人才引进等政策予以倾斜。通过有偿使用，可以促使教师释放“可用可不用”的资源，供学校总体调控;通过调控，厘清教学型和科研型实验室的空间、仪器设备等资源;通过厘清，学校总体协调实验室空间，为新引进人才保障实验室等硬件条件;通过保障，促进学校又好又快发展。
　　
　　第二，树立“多功能、集约化”建设理念，提高使用效益。为突出特色和提高资源利用率，高校应全面统筹学科资源，实施优先发展策略，改变实验室越多越好、越全越好的陈旧观念，学习国外知名实验室的建设经验，突出“精”和“巧”，使实验室做到“一室多用，分时复用”，节省空间和经费，充分发挥投资效益，促进资源的整合共享。
　　
　　第三，引入网络预约系统，促进管理智能化、透明化。随着高校数字化校园系统的不断完善，建立仪器设备共享平台成为一种方便、快捷的预约方式，它将解决设备管理人员人工接受预约、安排和费用结算的现状，通过网上预约系统将主要精力投入到设备维护和测试分析上，改善因信息渠道不畅通，影响设备开放共享使用的状况，以及因预约先后、登记错误或费用计算引起的纠纷等问题，确保委托人员“有需而约，约则有用”。同时，用户可以通过预约系统对设备管理人员的服务进行评价，该评价与人员劳务补贴直接挂钩，有利于提高工作人员的服务质量。
　　
　　第四，运用多媒体技术，创新实验教学方法。实验室可将实验步骤和注意事项制作成动画或视频形式，放置在网站系统，供学生提前熟悉实验操作的全过程，帮助学生加深理解;也可通过实时录播系统，将实验室专业技术人员的操作过程同步播放到教室，供学生熟悉操作程序，理解实验目的和意义。为激发学生的学习兴趣，指导教师在保证传统授课方式的基础上，还应采取案例式、研讨式、启发式等多样化的教学方法，增强教学效果，同时加强实验教学考核，严格把关，避免形式主义，鼓励学生敢于创新。
　　
　　第五，加强实验室队伍专业化建设，提高服务质量。高校应高度重视实验室队伍建设，提高薪酬待遇，打通职称晋升通道，建设一支结构合理、发展稳定的队伍。可将其划分为实验教学人员、实验技术人员、实验管理人员、实验辅助人员四类，邀请知名教授承担部分实验教学课程，聘请热心实验室建设的中青年教师兼职担任实验技术人员，讲解实验原理和操作过程;设置实验管理专职人员，协调实验课程、仪器设备的使用安排;聘任部分优秀研究生作为实验辅助人员，协助管理实验室具体事务。
　　
　　第六，加强软实力建设，凝练实验室文化品质。实验室软实力是指实验室所拥有的一切精神性力，它包含精神、制度、环境三个方面。精神文化表现在实验室的治学理念、发展战略、价值观念，制度文化表现在实验室的规章制度、运行机制，环境文化表现在工作环境、建筑风格、学术氛围。因此，实验室需要挖掘治学传统，培育符合时代精神和现代科学发展规律的实验室文化，树立科学严谨的实验室精神;破除陈旧制度，坚持合理制度，不断创新制度的措施、方法和条件，适应时代发展需求;优化环境建设，集中展示实验室的发展历程、文化底蕴、研究成果、人才培养质量等内容，体现实验室特色，增强软实力的感召力，从而吸引汇聚社会多方资源，推动实验室跨越式发展。